Laitteen vakaus: Kun infrapunaspektrometri on kytketty päälle, sen stabiloituminen kestää jonkin aikaa. Yleensä suositellaan odottamaan 15 minuuttia virran kytkemisen jälkeen saavuttaaksesi maksimienergian, ennen kuin testaus voidaan suorittaa. Laitteen käyttöiän pidentämiseksi on parasta katkaista kaikki virransyöttö, kun sitä ei käytetä, jotta instrumentti ei vaurioidu, jos se on ollut päällä pitkään.
Ympäristövaatimukset: Infrapunaspektrometreillä on suhteellisen korkeat ympäristövaatimukset. Ympäristöissä, joissa on korkea kosteus, laite voi toimia virheellisesti. Siksi laboratorion lämpötila tulee pitää välillä 18-28 celsiusastetta ja kosteuden tulee olla alle 50 %, jotta laboratorio pysyy kuivana. Jos kohtaat sadekauden, on parasta kytkeä ilmankuivain päälle joka päivä. Lisäksi laboratorio tulee pitää puhtaana, hiljaisena, vapaana syövyttävistä kaasuista ja voimakkaista tärinän lähteistä ja poissa sähkömagneettisista häiriöistä, kuten matkapuhelimista, signaalitorneista ja syttyvistä ja räjähdysherkistä materiaaleista.
Näytteen käsittely: Testausprosessin aikana on tarpeen minimoida näytteiden ja puhdistusreagenssien ilmalle altistumisen aika ja määrä. Testin päätyttyä ilmanvaihtolaitteistoa on pidettävä toiminnassa jonkin aikaa ja testinäytteet ja puhdistusreagenssit on poistettava testihuoneesta. Jos testattu näyte tai puhdistusreagenssi on haihtuvaa ja sitä on väistämättä käytettävä, ryhdy seuraaviin ennaltaehkäiseviin toimenpiteisiin: riippumaton huonetestaus, poistolaitteiden asennus tunkeutumislähteen hallitsemiseksi, altistusajan ja reagenssien ja näytteiden annostelun minimoiminen testausprosessi, pakokaasulaitteiston pitäminen käynnissä jonkin aikaa testin päätyttyä ja näytteet ja reagenssit poistettaessa testaushuoneesta.
Laitteiston huolto: Infrapunaspektrometrin laitteisto-osa tarvitsee säännöllistä huoltoa. Esimerkiksi tabletin puristusmuotin käytön jälkeen kaikki osat tulee pyyhkiä puhtaaksi välittömästi. Puhdista ja kuivaa tarvittaessa vedellä ja säilytä kuivausrummussa ruostumisen estämiseksi.
Ohjelmiston ylläpito: Tietokoneisiin liitettyjen infrapunaspektrometrien osalta tulee myös kiinnittää huomiota ohjelmistojen ylläpitoon, kuten säännölliseen tietojen varmuuskopiointiin ja välimuistin puhdistamiseen.